现代解析
这首对联讲的是体育学校的使命，用大白话来解释就是：
上联说体育学校要培养学生两样本事：一是"御外患"——教学生练好体魄和战斗技能，像军人一样能保家卫国；二是"靖内忧"——通过严格训练磨炼意志，改掉懒散毛病。就像老话说的"知耻而后勇"，让学生明白弱就要挨打，从而发愤图强。
下联说的是体育运动的医疗作用："针膏肓"比喻运动像针灸治病，能调理身体隐患；"起废疾"指锻炼能让体弱的人恢复健康。最后点明根本目的：增强全民体质（卫生强种），唤醒中国人尚武的精神（武士精神），让民族重新强盛起来。
全篇最妙的是用治病来比喻体育——既治个人身体的病，也治民族精神的病。把跑跳投掷这些日常锻炼，一下子升华到了救国救民的高度，读起来特别提气。就像现在说"体育强则中国强"，百年前这对联早就把道理说透了。