现代解析
这首对联写得非常巧妙，用大白话讲就是一位军医的美好愿望。
上联"但愿三军日月平安，神针不用"意思是：真心希望将士们永远健康平安，这样连治病的神针都用不上。这里"神针"代指医术，"不用"反而成了好事，表达了军医希望军队无病无灾的心愿。
下联"非明百药君臣佐使，畜艾无灵"说的是：如果不懂中药配伍的学问（"君臣佐使"指中药配方的原则），就算存再多艾草（古代常用药材）也没用。这句话既展现了军医的专业性，也暗示治病救人的真本事在于医术，而不在于囤积药材。
全联最打动人的地方在于：
1. 用对比手法：上联说"不用"是福气，下联说"不懂"是徒劳
2. 展现了军医的双重身份：既是祈愿平安的战友，又是精通医术的专业人士
3. 语言朴实但意境深远：没有华丽辞藻，却把医者仁心表达得淋漓尽致
就像现在医生常说"但愿世间人无病，何惜架上药生尘"，这份希望病人少生病的心意，古今医者都是一样的。