现代解析
这首诗描绘了一株罕见的双头紫芝（灵芝的一种），通过赞美它的独特和珍贵，寄托了兄弟情深和对理想生活的向往。
前两句“三秀何年种，双花独自攀”用提问的方式引出主题：这株神奇的双头灵芝不知是何年种下，如今独自绽放出两朵花。“三秀”是灵芝的雅称，“双花”则点明其罕见特性。
中间四句通过比喻展现双头灵芝的珍贵和兄弟情谊。“阶庭分谢树”说它像庭院里分开生长的珍贵树木，“兄弟共商山”则用商山四皓的典故（四位隐士共同隐居），暗指兄弟和睦共处。括号里的注释补充说明诗中人物关系，让比喻更具体。
“华盖春云紫，金茎晓露殷”用华丽意象描写灵芝的外形：紫色的菌盖像春云，沾满晨露的菌柄如同金色柱子。这两句画面感极强，突出灵芝的祥瑞之气。
最后两句“芝房歌再起，苦忆汉京还”借古抒怀。诗人看到灵芝想起汉代《芝房歌》（歌颂祥瑞的乐曲），进而感慨自己何时能像古人一样实现理想。这里的“汉京”象征理想中的盛世，透露出对现实的不满和归隐之思。
全诗妙在将自然景物、兄弟情谊和个人抱负融为一体。写双头灵芝的罕见，暗喻兄弟同心；赞灵芝的祥瑞，寄托对美好生活的期待。语言清新雅致，用典自然，展现出明代文人将生活诗意化的情趣。